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2014
CABRAL, Célia; PITA, João Rui; SALGUEIRO, Lígia - Plantas medicinais: entre o passado e o presente: a colecção de fármacos vegetais da Faculdade de Farmácia da Universidade de Coimbra (séculos xix-xx). 2.ª ed. ed. Coimbra: [s.n.]. ISBN 978-989-26-0874-7.
2009
PITA, João Rui - A Escola de Farmácia de Coimbra: 1902-1911. Coimbra: [s.n.]. ISBN 978-989-26-0163-2 (PDF).
2006
RIEDER, Philip; PEREIRA, Ana Leonor; PITA, João Rui - História ecológico-institucional do corpo. Coimbra: [s.n.]. 52 p. ISBN 978-989-26-0233-2 (PDF).
Miguel Bombarda e as singularidades de uma época: 1851-1910 - Miguel Bombarda e as singularidades de uma época: 1851-1910. Coimbra: [s.n.]. 207 p. ISBN 978-989-26-0362-9 (PDF).
PEREIRA, Ana Leonor; et al. - A natureza, as suas histórias e os seus caminhos. Coimbra: [s.n.]. 81 p. ISBN 978-989-26-0325-4 (PDF).
PITA, João Rui; PEREIRA, Ana Leonor - Rotas da natureza: cientistas, viagens, expedições, instituições. Coimbra: [s.n.]. 300 p. ISBN 978-989-26-0469-5 (PDF).
2000
ARAÚJO, Ana Cristina; et al. - O Marquês de Pombal e a Universidade. Coimbra: [s.n.]. 317 p. ISBN 978-989-26-0373-5 (PDF).